除了個(gè)別在PAGE膠上利用熒光或者酶活性直接做類似Western反應(yīng)的“前衛(wèi)”方法,印跡法的常規(guī)主流,無(wú)論是Southern、Northern還是Western Blot,都需要將電泳結(jié)果轉(zhuǎn)印到膜上固定,再進(jìn)行顯色顯影反應(yīng)。對(duì)于各種Blot來(lái)說(shuō),作為承載實(shí)驗(yàn)結(jié)果的載體,包括各類斑點(diǎn)雜交或者克隆轉(zhuǎn)印,膜的選擇就顯得很重要。
德國(guó)老牌的廠家Schleicher & Schuell是世界*個(gè)生產(chǎn)硝酸纖維素膜的廠家,其產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn)即為同類產(chǎn)品的行業(yè)標(biāo)準(zhǔn),產(chǎn)品質(zhì)量毋庸置疑,去年被對(duì)手之一的Whatman收購(gòu)而成為Whatman旗下產(chǎn)品。不過(guò)由于這個(gè)牌子的產(chǎn)品品種頗多,初次選擇時(shí)不免讓人眼花繚亂,上海力敏小編在這里特別介紹一下,便于大家選擇。
PVDF膜
Westran S:很高的蛋白質(zhì)結(jié)合效率和載量,即使很劇烈的反復(fù)洗滌條件也不影響目標(biāo)蛋白結(jié)合。0.2μm小孔徑,防蛋白質(zhì)滲漏。zui重要的是,PVDF膜化學(xué)性質(zhì)穩(wěn)定,可以兼容測(cè)序----將蛋白條帶剪下可以直接去N端測(cè)序。如果需要做蛋白質(zhì)測(cè)序,PVDF是*選擇。
Westran Clear Signal:和小S的區(qū)別是孔徑,這個(gè)是0.45μm,其他特性一樣,專為蛋白質(zhì)Western用的。由于孔徑大,轉(zhuǎn)移速度也比較快,截留的背景更少,信號(hào)就更清晰。CS可以兼容常規(guī)的蛋白燃料,比如麗春紅,氨基黑,靠馬斯亮藍(lán)染色。
PVDF膜用前需要“飄在”甲醇液面浸潤(rùn)(通風(fēng)櫥操作),然后才能進(jìn)行下一步。轉(zhuǎn)移方法適用于半干轉(zhuǎn)或者電轉(zhuǎn),其他不適合。而固定的方法主要采用干燥固定。顯色,包括化學(xué)發(fā)光法和同位素,化學(xué)顯色法,都適合PVDF膜。
硝酸纖維素膜:
Protran:純的硝酸纖維素膜。在所有膜中,Protran膜的封閉zui簡(jiǎn)單容易,從而可有效阻斷非特異結(jié)合,降低背景,無(wú)需嚴(yán)謹(jǐn)清洗即可得到良好的信噪比;廣泛適用于同位素、化學(xué)發(fā)光法、顯色法和熒光法等不同的標(biāo)記顯色方法,適用于包括Southern,Northern,Western Blot在內(nèi)的多種實(shí)驗(yàn)。對(duì)于基于HRP的化學(xué)發(fā)光法印跡反應(yīng),效果尤佳。不過(guò),由于是純硝酸纖維素膜,比較脆,操作上要特別注意。Protran孔徑分為0.45μm;0.2μm;0.1μm這3種。0.45μm膜通常適用于分子量大于20KD的蛋白分子和300bp以上大小的核酸;而0.2μm膜則由于密度大孔徑小能有效減少“滲漏”,更適用于分子量小于20KD的蛋白質(zhì)分子,包括300bp以下的短鏈DNA或者寡核苷酸。而0.1μm膜則是用來(lái)對(duì)付7KD以下的蛋白質(zhì)小家伙們的。如果你的實(shí)驗(yàn)中的小分子蛋白質(zhì)Western Blot老做不好(比如EGF),大概有可能就是膜的孔徑不夠小,漏掉拉(當(dāng)然電泳Buffer不用甘氨酸也是竅門之一)。硝酸纖維素膜不需要甲醇預(yù)先浸潤(rùn),用前直接鋪在在水面滲透潤(rùn)濕后就可以使用。Protran的另外一個(gè)小小優(yōu)點(diǎn)是非常穩(wěn)定,5年前保存Western Blot的實(shí)驗(yàn)結(jié)果在歷時(shí)5年后再次做顯色反應(yīng),依然能正確顯色。雖說(shuō)需要重復(fù)用到5年前結(jié)果的,好像很少見,但能說(shuō)明其性質(zhì)穩(wěn)定,可保存蛋白質(zhì)。
在操作上,除了小心之外,Protran硝酸纖維素膜適用于常規(guī)電轉(zhuǎn)、半干轉(zhuǎn)、真空轉(zhuǎn)、毛細(xì)轉(zhuǎn)移,但不適合用堿法。固定方法,如果樣本是核酸,可以用紫外交聯(lián)或者80度烘干固定,蛋白質(zhì)則只需要干燥固定即可。Protran適用于各種通用的顯色方法如化學(xué)顯色,化學(xué)發(fā)光,同位素和熒光法。
Optitran:夾心的硝酸纖維素膜,中間的聚酯基質(zhì)兩面均勻覆蓋硝酸纖維素,使得該種膜具有硝酸纖維素膜的所有優(yōu)點(diǎn)同時(shí)兼具強(qiáng)韌性,特別適合需要反復(fù)操作的實(shí)驗(yàn),比如需要多次重復(fù)標(biāo)記雜交和重復(fù)洗脫的實(shí)驗(yàn)----有時(shí)候?qū)ν粋€(gè)電泳結(jié)果需要Western檢測(cè)多個(gè)目標(biāo)蛋白,在檢測(cè)*個(gè)目標(biāo)蛋白后,可用酸洗(如0.2MGlycine/0.5MNaCl,pH2.8)2-5min,Tris中和,從而洗脫*個(gè)目標(biāo)蛋白抗體,再進(jìn)行第二個(gè)目標(biāo)抗體的檢測(cè),Optitran的強(qiáng)韌的高耐受性正好適合這類重復(fù)操作的要求。Optitran膜0.45μm和0.2μm兩種孔徑規(guī)格提供,除了單位面積zui大載量相對(duì)Protran會(huì)小一些,其他選擇和使用和Protran都是一樣的。Optitran由于帶有聚酯,通常不推薦用熒光檢測(cè)。
尼龍膜
Nytran SuPerCharge:帶高正電荷的尼龍膜。尼龍膜柔軟,強(qiáng)韌,耐折疊,可耐受強(qiáng)度較高的機(jī)械操作,這一點(diǎn)上遠(yuǎn)勝于硝酸纖維素膜,并因而廣泛用于膜芯片,Macroarray,或者預(yù)制核酸雜交膜上。通常核酸分子在電泳條件下是帶負(fù)電,尼龍膜上電荷越高,吸附帶負(fù)電的核酸分子的能力越強(qiáng),不過(guò)蛋白質(zhì)荷電特性與核酸不同,尼龍膜更常見用于Southern或者Northern。Nytran SuPerCharge經(jīng)過(guò)特殊處理,均勻附著在中間介質(zhì)兩面,表面孔徑均一,電荷量是常規(guī)帶正電核酸膜的3倍,對(duì)核酸的吸附更強(qiáng),更重要的是經(jīng)過(guò)特殊處理,克服以往帶電尼龍膜背景高的弱點(diǎn),能得到良好的信噪比。
尼龍膜適用于各種轉(zhuǎn)移方法,如電轉(zhuǎn),半干轉(zhuǎn),毛細(xì)管,堿法等,固定方法是紫外交聯(lián)。不過(guò)就不太適合化學(xué)顯色和熒光檢測(cè)。因?yàn)槟猃埍旧碛袩晒?,?huì)干擾結(jié)果;而化學(xué)顯色劑的微小顆粒容易附著而產(chǎn)生斑點(diǎn)背景。
Nytran同樣分0.45μm和0.2μm孔徑,分別適合300bp以上或者以下的核酸片段。選擇的標(biāo)準(zhǔn)是看你的核酸大小。
Nytran N是常規(guī)帶正等電荷的尼龍膜。除了荷電小其他特性和差不多,如果你不想要高電荷,這個(gè)就是一選擇。